本法人はJ-PEM事務局として誕生し、本格的な日本版PEM(J-PEM)としてJ-PEM2000を実施しました（詳しくはJ-PEMホームページをご覧ください（リンク集にある東京大学医学部薬剤疫学講座のホームページからお入りください）。しかし、わが国では薬剤疫学研究の実施基盤が脆弱なため、情報取得に要する労力・費用に比して得られる情報の量と質は十分大きいとはいえず、研究の効率が極めて低く、平成16年にJ-PEMが実質的に凍結されました。
その後は、J-PEM再生をめざし、比較観察研究全般の実施基盤を整備するための事業に取り組んでいます。平成16年〜18年には、｢病院および保険薬局のコンピュータを利用したコホートの特定に関する調査｣を実施しました。
現在、以下のことを行っております。